吴尊出道以来，先后与林依晨、S.H.E的Ella、张韶涵传过绯闻，其实，在他背后，有一位相恋15年的圈外女友林丽莹。　　

　　如今结婚四年，吴尊女儿“内内”也已经三岁了，不仅长得清秀甜美，更是吴尊心里宠溺的小公主。在最新流出的节目片花中父女两个还大穿亲子装一起逛超市，小“内内”留着齐刘海蘑菇头，模样十分讨人喜欢，坐在吴尊的手推车里十分乖巧，吴尊看上去也完全不像是一个已经当爹的人，两人看起来更像是“兄妹”。 　　

   由于工作的特殊性，吴尊很少有时间跟女儿待在一起，也正是这个原因，让吴尊格外珍惜孩子们相处的时间。不过这也使得他对女儿的教育并没有那么西方化，反而变得比较传统，用吴尊的话来说，“我属于那种保护孩子型”。吴尊更透露，从来不跟女儿发火，即使她做错事的时候：因为一看到她看我的眼神，就说不了重话了，感觉心都软化了。有了爸爸深深的宠爱，小“内内”调皮起来也就有恃无恐了。不仅跟爸爸大玩互咬手指的游戏，还学爸爸吴尊扮起了大怪兽。吴尊，你这样带孩子，你的粉丝知道吗？不知道尊粉看完之后又该做何感想呢？

   吴尊透露：“结婚生仔都是计划之内的事，太太跟我的性格其实很相似，我们都是有话直说的人，所以大家都会很了解对方，拍拖十八年一直相处得很好，我们都知道爱一个人就要珍惜，要努力付出，我们也早已经认定对方是结婚对象，她跟我同年龄，我希望她能够在年轻的时候结婚生BB, 因为照顾孩子是很需要体力的，我跟她决定结婚和生BB都是人生走到一个阶段很自然发生的事，我们的婚礼很简单，在家里举行，只有亲人见证，当年我们没宴请朋友，我也有打算补办一个celebration party，跟朋友一同庆祝。”