分析人士表示，非洲自贸区正式启动后，后续建设会面临不少挑战，如各成员经济发展水平差距较大、专业人才缺乏、基础设施不足以及疫情冲击、政治动荡和安全问题等。由于非洲自贸区与非洲次区域组织共同存在，一体化程度不同步，自贸协定效力也可能被削弱。

　　但专家指出，长远来看，非洲自贸区有望加速促进区域内贸易往来，创造就业机会，提升非洲大陆对外商投资的吸引力。世界银行2020年7月发布的报告指出，若非洲自贸区得以全面实施，到2035年非洲将获得近4500亿美元实际收益。到2035年，非洲地区总出口量将增加近29%，其中洲内出口将增长逾81%，对非洲以外国家出口将增长19%。

　　阿明娜·穆罕默德说，非洲自贸区预计将使非洲各国间工业产品贸易增长25%至30%，推动非洲工业化进程，助力非洲经济在应对疫情的同时实现可持续复苏。